Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HES3Q5TGS1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms