Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PCID2Q5JVF3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms