Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00303Q3SY05 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00303Q3SY05 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms