Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
MSMPQ1L6U9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms