Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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