Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NTRK2Q16620 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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