Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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RPE65Q16518 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPE65Q16518 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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