Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GRIK4Q16099 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GRIK4Q16099 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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