Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
USF2Q15853 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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