Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
R3HDM1Q15032 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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