Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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