Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RFTN1Q14699 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RFTN1Q14699 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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