Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PDE7AQ13946 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE7AQ13946 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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