Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TOP3AQ13472 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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