Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FOXE3Q13461 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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