Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PTPRSQ13332 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPRSQ13332 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms