Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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RPA4Q13156 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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