Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BNIP3Q12983 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BNIP3Q12983 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms