Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFFO1Q0D2I5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms