Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN11Q06124 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms