Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BNC1Q01954 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms