Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
DEFA6Q01524 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DEFA6Q01524 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms