Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms