Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK16Q00536 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms