Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms