Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFM1P61960 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms