Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ATP6V0D1P61421 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms