Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVPABLB-1P60509 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms