Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NME5P56597 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NME5P56597 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms