Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTBP2P56545 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTBP2P56545 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTBP2P56545 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms