Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
THOP1P52888 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
THOP1P52888 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms