Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTPAP49638 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTPAP49638 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TTPAP49638 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTPAP49638 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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