Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNPDA1P46926 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms