Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms