Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTN2P35609 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms