Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPA3P35244 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPA3P35244 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms