Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXA10P31260 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms