Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HLA-FP30511 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms