Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KDM5AP29375 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM5AP29375 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms