Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CD27P26842 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CD27P26842 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD27P26842 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms