Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSMA4P25789 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms