Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATP5A1P25705 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms