Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
APCP25054 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
APCP25054 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms