Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRKCHP24723 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRKCHP24723 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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