Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRHP20396 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRHP20396 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRHP20396 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRHP20396 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRHP20396 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRHP20396 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRHP20396 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRHP20396 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRHP20396 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRHP20396 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms