Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCNA2P20248 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms