Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TPRP12270 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TPRP12270 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TPRP12270 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TPRP12270 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TPRP12270 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TPRP12270 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TPRP12270 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRP12270 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRP12270 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRP12270 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRP12270 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRP12270 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRP12270 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRP12270 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRP12270 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRP12270 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms