Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DMDP11532 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DMDP11532 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DMDP11532 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DMDP11532 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DMDP11532 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DMDP11532 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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