Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBSLP0DN79 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms