Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C8orf89P0DMQ9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C8orf89P0DMQ9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms